Gabedit - открытый визуализатор
После упоминания Кемкрафта (http://inchem.ru/content/khimicheskii-vizualizator-chemcraft) хотелось бы рассмотреть бесплатный open-source продукт для визуализации данных квантово-химических расчетов.
Сегодня рассмотрим Gabedit графический интерфейс пользователя к таким программам как GAMESS (US) , GAUSSIAN, MOLCAS, MOLPRO ,MPQC, OpenMopac, и Q-Chem.
Эта программа написана с использованием библиотеки gtk, что обеспечивает ей замечательную кроссплатформенность, но привносит некоторые неудобства в интерфейс (с которыми можно смириться, учтя достоинства «смотрелки»).
Может же Габедит многое:
- создавать входные файлы для GAMESS(US), GAUSSIAN, MOLCAS, MOLPRO , MPQC, OpenMopac, PCGamess и Q-Chem.
- отображать результаты расчетов программами Gamess-US, Gaussian, Molcas, Molpro, MPQC, OpenMopac, PCGamess, Q-Chem включая:
- молекулярные орбитали;
- поверхности электронной плотности, электростатического потенциала, ЯМР экранирование и другие. Поверхности могут быть как сплошные, так и прозрачные и каркасные, причем, могут быть произвольно «раскрашены», что встречается нечасто в визуализаторах.
- Анимацию нормальных колебаний;
- Анимацию вращения геометрии, поверхностей, контуров, плоскостей и осей молекул;
- Отображение расчитанных UV-Vis, ИК и КР спектров (в очень «красивом» виде:);
- Возможность сохранения BMP, JPEG, PNG, PPM и PS изображений и способность автоматической генерации наборов картинок для анимаций.
- Собственная реализация молекулярной динамики с параметрами Amber 99.

В общем, впечатление от программы очень благоприятное: есть практически все неоходимые для визуализатора/редактора функции, понятная в освоении и выдает довольно качественные картинки.
Рекомендую ознакомиться с ее возможностями всем, кому приходится сталкиваться с молекулярным моделированием или просто иногда создавать химические иллюстрации.
Скачать или поучаствовать в разработке можно на оф. сайте http://gabedit.sourceforge.net/
- Комментировать (войти или зарегистрироваться)







Комментарии
Ну, никогда ещё не встречал
Ну, никогда ещё не встречал таких пиков в области 3000 и дальше!